Syndfloden handler om en mann, Francois Besson, som i tretten dager i sitt liv avstår fra alt som binder han til livet. Den trettende dagen legger han seg i sola på stranden for å forsone seg med virkeligheten. De tretten dagene er fordelt på tretten kapitler og er innrammet av en prolog og en epilog. Forvirringen og redselen man kan føle i store bysamfunn er tema i denne boka.